В Ubuntu как такового генератора md5 для строки нет. Зато есть md5sum который генерит md5 для файлов (и как я понимаю из stdin тоже). Нашел и подправил небольшой скрипт, который можно добавить в .bash_aliases и имеем command line генератор md5 для строк.
Собственно скрипт:
Собственно скрипт: